home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Hyper Stacks 1994 May / Hyper Stacks (Pacific HiTech)(1994)[Mac].iso / Science / Biology / Protein Structure / Protein Models / Alpha Helix next >
Text File  |  1993-05-13  |  3KB  |  136 lines
  1. ; Stick colour
  2. 2(0.700000, 0.700000, 0.700000)
  3. ; Model
  4. SF
  5. ; Definitions
  6. C = 27.164304, 10.869438(0.500000, 0.500000, 0.500000)
  7. H = 13.080486, 5.239626(1.000000, 1.000000, 1.000000)
  8. N = 25.863687, 10.349191(0.000000, 0.000000, 1.000000)
  9. O = 24.767454, 9.903265(1.000000, 0.000000, 0.000000)
  10. ; Instances
  11. N1 :    -172.257361    22.077965    -11.944304
  12. C2 :    -155.057637    38.997127    0.238756
  13. C3 :    -135.574402    24.452519    14.474932
  14. O5 :    -113.662731    27.434646    10.554503
  15. H7 :    -189.776665    25.117691    -5.433790
  16. H8 :    -168.309061    4.270667    -6.803153
  17. N9 :    -144.678718    3.939939    26.449894
  18. C10 :    -127.423253    -11.581990    40.299601
  19. C11 :    -107.975321    -22.122557    22.826748
  20. O13 :    -86.039495    -18.936047    26.490770
  21. H15 :    -162.712694    4.489914    32.187470
  22. N16 :    -116.996025    -29.223923    0.064102
  23. C17 :    -99.725697    -39.121614    -18.220708
  24. C18 :    -80.353943    -19.645812    -24.556568
  25. O20 :    -58.403253    -23.869099    -22.310217
  26. H22 :    -135.037434    -34.905759    -0.762719
  27. N23 :    -89.473123    4.088581    -26.304968
  28. C24 :    -72.277115    24.209117    -31.780563
  29. C25 :    -52.871917    26.039271    -11.431490
  30. O27 :    -30.934234    24.883580    -16.108135
  31. H29 :    -107.516389    6.106394    -31.676514
  32. N30 :    -61.965084    22.332514    12.074366
  33. C31 :    -44.743064    23.183489    32.887945
  34. C32 :    -25.263546    3.009069    30.035879
  35. O34 :    -3.338868    7.908677    29.939262
  36. H36 :    -80.017641    27.053752    15.275740
  37. N37 :    -34.289824    -19.079115    21.117366
  38. C38 :    -16.997199    -39.482071    17.209943
  39. C39 :    2.428437    -32.061125    -1.823650
  40. O41 :    24.362404    -32.997569    2.944038
  41. H43 :    -52.318226    -23.332130    25.032222
  42. N44 :    -6.675879    -18.406510    -21.305027
  43. C45 :    10.564722    -9.891188    -40.299601
  44. C46 :    29.956913    7.027974    -28.796578
  45. O48 :    51.900171    2.654187    -30.829255
  46. H50 :    -24.693133    -21.344045    -26.325406
  47. N51 :    20.800573    22.860192    -11.084039
  48. C52 :    38.000297    39.482071    1.502212
  49. C53 :    57.476100    24.524981    15.344487
  50. O55 :    79.397061    27.587004    11.507669
  51. H57 :    2.772171    28.378522    -12.821291
  52. N58 :    48.401513    3.663093    26.760184
  53. C59 :    65.681132    -12.297329    40.074780
  54. C60 :    85.166224    -22.321366    22.343662
  55. O62 :    107.083470    -19.194312    26.167474
  56. H64 :    30.384259    4.053278    32.568365
  57. N65 :    76.082347    -28.750127    -0.545330
  58. C66 :    93.373114    -38.025380    -19.134855
  59. C67 :    112.783886    -18.419516    -24.909592
  60. O69 :    134.715996    -22.784013    -22.756143
  61. H71 :    58.091105    -34.578747    -1.448329
  62. N72 :    103.601534    5.288864    -25.974240
  63. C73 :    120.814264    25.559901    -30.808817
  64. C74 :    140.256622    26.815924    -10.437447
  65. O76 :    162.183157    25.786579    -15.218142
  66. H78 :    85.601002    7.414443    -31.442403
  67. N79 :    131.115146    22.449569    12.897470
  68. C80 :    148.359462    22.616791    33.711050
  69. C81 :    167.874283    2.568718    30.296003
  70. O83 :    189.776665    7.546363    30.346169
  71. H85 :    113.107182    27.256276    16.236339
  72. O86 :    160.771059    -20.829373    26.988721
  73. ; Bonds
  74. N1, C2
  75. N1, H7
  76. N1, H8
  77. C2, C3
  78. C3, O5
  79. C3, N9
  80. N9, C10
  81. N9, H15
  82. C10, C11
  83. C11, O13
  84. C11, N16
  85. N16, C17
  86. N16, H22
  87. C17, C18
  88. C18, O20
  89. C18, N23
  90. N23, C24
  91. N23, H29
  92. C24, C25
  93. C25, O27
  94. C25, N30
  95. N30, C31
  96. N30, H36
  97. C31, C32
  98. C32, O34
  99. C32, N37
  100. N37, C38
  101. N37, H43
  102. C38, C39
  103. C39, O41
  104. C39, N44
  105. N44, C45
  106. N44, H50
  107. C45, C46
  108. C46, O48
  109. C46, N51
  110. N51, C52
  111. N51, H57
  112. C52, C53
  113. C53, O55
  114. C53, N58
  115. N58, C59
  116. N58, H64
  117. C59, C60
  118. C60, O62
  119. C60, N65
  120. N65, C66
  121. N65, H71
  122. C66, C67
  123. C67, O69
  124. C67, N72
  125. N72, C73
  126. N72, H78
  127. C73, C74
  128. C74, O76
  129. C74, N79
  130. N79, C80
  131. N79, H85
  132. C80, C81
  133. C81, O83
  134. C81, O86
  135. ••Alpha Helix
  136. ••Rotate the model around the x-axis to see the helix more clearly. Rotate the model aroud the y-axis. Seen from the end there is no free volume inside the helix.